Quando você está usando um repositorio via ssh e o server não utiliza a porta padrão você deve fazer da seguinte forma:
$ git clone ssh://usuario@domain.com:<porta>/<project name>
exemplo:
$ git clone ssh://ramon@ramon.com:88/home/ramon/projeto.git
Fontes:
http://readystate4.com/2011/03/30/working-with-git-repos-on-non-standard-ports/